フラグメント分子軌道法による生体分子計算システムの開発 田中 成典　（たなか　しげのり） 神戸大学大学院 大学院 工学研究科 教授 URL http://insilico.h.kobe-u.ac.jp/tanaka/ http://insilico.h.kobe-u.ac.jp/ 【研究課題概要】 本研究では巨大分子の電子状態を非経験的に計算する効率的な手法であるフラグメント分子軌道法のプログラムABINIT-MPを基に、金属を含んだ酵素反応や光励起反応も扱えるように機能を拡張し、汎用の第一原理生体分子シミュレーションシステムを開発します。これにより、中規模のPCクラスターでも溶液中の蛋白質や核酸に関する現実的な生体化学反応の分子シミュレーションが可能となり、生体の機能解明や創薬等に大きく寄与すると期待されます。 　 ■神戸大学グループ 研究全体の総括、プリポスト機能の開発、生体系での応用・ 実証計算 田中 成典 神戸大学大学院 大学院人間発達環境学研究科 教授 ■国立医薬品食品衛生研究所グループ FMO法の周期境界条件への拡張 中野 達也 国立医薬品食品衛生研究所 安全情報部 主任研究官 ■産業技術総合研究所グループ FMO-MD法ソフトの開発と応用 古明地　勇人 （独）産業技術総合研究所 計算科学研究部門 主任研究員 ■九州大学グループ モデル内殻ポテンシャル（MCP）による重元素の計算 三好 永作 九州大学大学院 総合理工学研究院 融合創造理工学部門 教授 ■筑波大学グループ 密度汎関数（DFT）法の組み込み 守橋 健二 筑波大学大学院 数理物質科学研究科 化学専攻 准教授 ■徳島大学グループ 生体系の応用計算 -FMO法による新しい構造生物学の構築と創薬への応用- 中馬 寛 徳島大学大学院ヘルスバイオサイエンス研究部 生体情報薬科学部門 教授 ■立教大学グループ 新規FMO計算手法の開発とその応用 -FMOに基づく多配置SCF法ならびに分子物性値計算手法の実装、蛋白質ならびに凝集系へのFMO計算の応用- 望月 祐志 立教大学 理学部化学科 准教授 ■お茶の水女子大グループ モデル内殻ポテンシャル（MCP）法に基づく生体分子・凝集系のモデリング 森 寛敏 お茶の水女子大学 アカデミック・プロダクション 特任助教